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浙江突破AI診斷技術(shù)疑似病例基因分析縮至半小時(shí)

放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2020-02-01 20:12:12    瀏覽次數(shù):77
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針對(duì)新型冠狀病毒的AI診斷技術(shù),將在浙江大規(guī)模應(yīng)用!2月1日,浙江省疾控中心上線自動(dòng)化的全基因組檢測分析平臺(tái)。利用阿里達(dá)摩院研發(fā)的AI算法,可將原來數(shù)小時(shí)的疑似病例基因分析縮短至半小時(shí),大幅縮短確診時(shí)

針對(duì)新型冠狀病毒的AI診斷技術(shù),將在浙江大規(guī)模應(yīng)用!2月1日,浙江省疾控中心上線自動(dòng)化的全基因組檢測分析平臺(tái)。利用阿里達(dá)摩院研發(fā)的AI算法,可將原來數(shù)小時(shí)的疑似病例基因分析縮短至半小時(shí),大幅縮短確診時(shí)間,并能精準(zhǔn)檢測出病毒的變異情況。

當(dāng)前,全國新型冠狀病毒肺炎疫情依然嚴(yán)峻,快速、精確診斷對(duì)于疫情控制尤其重要。公開信息顯示,該病毒是基因組序列最長的病毒之一,全基因組序列全長29847bp,臨床診斷需要將患者樣本與該病毒基因序列進(jìn)行比對(duì)才能確定診斷結(jié)果。

目前醫(yī)院普遍采用核酸檢測方法,其只能檢測到病毒基因的局部。由于病毒存在變異的可能性,對(duì)于整個(gè)基因序列來說這種檢測方法猶如盲人摸象,一旦病毒發(fā)生變異,就可能出現(xiàn)漏檢的情況。

浙江的全基因組檢測分析平臺(tái)由浙江省疾病預(yù)防控制中心、阿里達(dá)摩院醫(yī)療AI團(tuán)隊(duì)和杰毅生物技術(shù)公司共同研發(fā)。該平臺(tái)采用不同于核酸檢測方法的全基因組檢測技術(shù),對(duì)疑似病例的病毒樣本進(jìn)行全基因組序列分析比對(duì),能夠有效防止病毒變異產(chǎn)生的漏檢,并將原需數(shù)小時(shí)的全基因分析流程減少到半小時(shí),大幅提高疑似病例的確診速度和準(zhǔn)確率。

疫情發(fā)生后,達(dá)摩院算法專家顧斐博士立即奔赴浙江省疾控中心,第一時(shí)間針對(duì)新型冠狀病毒基因進(jìn)行特征分析,并推出多個(gè)算法模型。在序列比對(duì)過程中,達(dá)摩院對(duì)算法增加了分布式設(shè)計(jì),有效提升比對(duì)效率;在病毒序列拼接階段使用分布式設(shè)計(jì)的de Bruijn圖算法,變異病毒也能精準(zhǔn)檢測。

浙江省疾控中心基因測序負(fù)責(zé)人孫逸博士表示:“該平臺(tái)基于阿里云的強(qiáng)大算力與達(dá)摩院新算法可以為病毒的解析提供支撐,基于該平臺(tái),未來還可以在短時(shí)間內(nèi)將檢測范圍覆蓋整個(gè)確診病例,也為后續(xù)疫苗與藥物研發(fā)打下了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。”

 
關(guān)鍵詞: 達(dá)摩 病毒 基因組 基因 序列
(文/小編)
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